1954年12月23日,輕工業管理局以(54)辦字第04647號文通知，“東北制藥總廠研究室自1955年起，成為獨立單位。
1955年1月1日東北制藥總廠研究室從藥廠。
1956年6月化工部成立。輕工業部醫藥管理局制藥工業研究室改名為：化工部沈陽化學合成藥物研究所，隸屬化工部領導。
1957年8月29日沈陽化學合成藥物研究所搬遷至天津作為化工部天津化學研究所的藥物研究室。
1958年10月天津市制藥工業公司撤銷，所屬技術研究室并入天津市化學工業研究所。
1959年6月化工部設計研究院華北分院藥物室遷至北京。
1960年5月天津市化學工業研究所第四研究室（醫藥研究室）從該所分出成為獨立單位，名為：天津市醫藥工業研究所（簡稱天津醫工所），隸屬天津市制藥工業公司領導。同年渤海藥廠并入該所。
1962年12月9日天津醫工所將1960年并入該所的渤海藥廠從該所分出。全所遷至天津市東馬路163號、扒頭街50號和小洋貨街27號等三處辦公和開展科研試驗。北京醫藥工業研究設計院更名為：北京醫藥工業研究院（簡稱北京醫工院）。
1965年1月1日化工部中國醫藥工業公司將北京醫工院、天津醫工所收為直屬單位。
1969年12月中國醫藥工業公司解散。北京醫工所和天津醫工所改屬化工部領導。12月13日醫工院作為戰備搬遷單位，下放至湖南省邵陽市中南制藥廠，名為：中南制藥廠研究所。
1970年1月遵照化工部軍管會通知，中南制藥廠研究所承擔“化工部中草藥情報中心站”任務并創刊《中草藥通訊》（內部發行）。1970年4月化工部將天津醫工所下放天津市，隸屬天津市化工局領導。
1974年 7月6日天津市中藥研究所成立，隸屬天津市一商局領導，天津藥材公司代管。
1981年07月1日天津醫工所改屬天津市醫藥管理局領導。
1982年03月9日天津醫工所和天津市中藥研究所隸屬關系調整為國家醫藥管理局和天津市雙重領導，以國家醫藥管理局為主。
1986年01月《中草藥》獲國家科委科技情報成果二等獎；《中文科技資料目錄——中草藥》獲全國科技文獻檢索期刊三等獎。
1987年04月5日國家科委批準天津醫工所和天津中藥所合并，組建國家醫藥管理局天津藥物研究所。
1987年11月17日國家醫藥管理局批準天津藥物研究所改名為：國家醫藥管理局天津藥物研究院。直屬國家醫藥管理局領導。天津中藥所和天津醫工所正式合并辦公。
1989年04月1日國家醫藥管理局批準，擔任國家醫藥管理局天津藥品質量檢測中心任務。
1990年09月國家技術監督局將(90)量認(國)字(S0490)號計量認證合格單位證發給天津藥物院，至此該院成有資格向社會提供公正數據的合法檢測單位。
1990年11月8日國家醫藥管理局批準天津藥物院承擔國家醫藥管理局制藥用原料(中間體)、輔料標準化技術歸口單位任務。
1991年01月21日天津藥品質量檢測中心獲國家技術監督局以(90)量認(國字)(S0490)號文頒發的“中華人民共和國計量合格證書”。
1994年04月我院與北京思必達醫藥新技術公司聯營，合資組建“天津藥物研究院藥業有限責任公司”正式簽約。
1995年03月1日天津藥物研究院藥業有限責任公司正式運行，6月1日正式投產，副院長李樹德任公司經理。
1997年01月15日
格列吡嗪及其片劑、吉非羅齊及其膠囊以及鹽酸羥甲唑啉及其滴鼻液分別獲國家醫藥局科技進步三等獎。鹽酸丁丙諾啡及其注射液獲國家醫藥局科技進步二等獎。
2000年08月 SDA以國藥管辦[2000]344號文件批復我院進入天津市醫藥集團有限公司。中共天津市委以津黨[2000]35號文件明確我院進入天津市醫藥集團公司后黨的工作歸口天津市委工業工委，由天津市醫藥集團有限公司黨委管理。從10月1日起，我院轉制成為科技型企業。
2002年07月23日院藥業公司通過國家藥品監督管理局GMP認證。
2004年01月15日天津藥物研究院博士后科研工作站正式掛牌成立（文件：津博辦[2004]1號）。
2005年01月，國家新聞出版總署授予《中草藥》第三屆國家期刊提名獎。
2006年01月25日，我院與天津醫科大學合作申報博士和碩士學位授權點獲得國務院學位委員會辦公室批準（津學位
[2006]1號）。
2007年03月21日，我院
“天津市新藥安全評價研究中心”獲國家食品藥品監督管理局簽發的GLP認定證書。
2012年02月13日
天津新技術產業園區管委會與我院正式簽署項目用地協議，項目征地58.8畝，用于天津藥物研究院國家重點實驗室建設。
2013年01月 我院“鹽酸氨溴索注射液”項目獲得中國藥學會科學技術三等獎。安評中心順利通過AAALAC認證。
2014年02月 我院正式授牌成為第一批國家級知識產權示范企業。
2015年08月28日
我院藥業公司“天津市手性和晶型藥物制備技術企業重點實驗室”獲批為天津市企業重點實驗室。
2015年11月26日
我院釋藥技術與藥代動力學國家重點實驗室順利通過建設驗收。
